Con el cambio de enfoque en el trabajo de DFID en la región y el cierre de sus oficinas en Bolivia, las Organizaciones No Gubernamentales jugarán un papel muy importante en la canalización de los fondos de la cooperación británica para el desarrollo. Algunas de las ONGs británicas que trabajan en Bolivia son Oxfam GB, CAFOD, Servicio Internacional, WWF, Visión Mundial y Plan Internacional Inc. También tiene presencia en Bolivia la organización de expertos voluntarios British Consultancy Charitable Trust.